1953年6 月 1 日，台湾省立海事专科学校成立，首届招收驾驶科、轮机科、渔捞科学生。
1957年，学年改四年制，增加航运管理科、水产教育科、造船工程科、河海工程科，成立夜间部。
1964年，台湾省立海事专科学校升格为台湾省立海洋学院。
1973年，设立第一个研究所：渔业研究所。
1975年，签订第一所国际姊妹校-韩国国立釜山水产大学。
1979年，改制为“国立台湾海洋学院”。
1989年，改制大学，校名为“国立台湾海洋大学”。
1992年，代管国科会海研二号研究船，主导进行台湾北部海域海洋相关之研究调查工作，并参与 WOCE、KEEP 等大型国际合作观测计画。
1996年，与国际合作发展基金会合作，开设水产养殖技术与经营管理研习班，招收国际学员。
2005年，追求卓越顶尖，获得2005台湾教育部奖励大学教学卓越计划补助，2006年获得教育部5年500亿推动卓越大学及顶尖研究中心之计划补助，筹设水产生物科技顶尖研究中心。
2007年为参与教育部“繁星计划”二十五所大学之一。
2007年11月财团法人高教评鉴中心公布“95年大专校院产学合作绩效评量结果”，海大与成大、清大、交大在所有国立大学中表现较优。
2007年6月16日，国立台湾海洋大学正式向经济部智慧财产局取得简称“海大”之专属权利，限制日后其他大专院校不得再使用该简称。
2012年，英国泰晤士报高等教育(Times Higher Education)特刊公布 2011-2012 世界大学前400 大排名，本校首次进榜位列351-400 名之间。
2015年，英国泰晤士(Times)高等教育专刊亚洲 100 大排名，本校首次进榜位列 72 名。
台湾海洋大学校徽
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