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肽链合成的延长

时间:2022-02-12 理论教育 版权反馈
【摘要】:肽链合成的延伸指第2个和以后的密码子编码的氨基酸进入核糖体,并形成肽键的过程。在肽链延长阶段中,每生成1个肽键,都需要直接从2分子GTP获得能量。随着GTP水解成GDP,这些因子构象发生了很大变化,与核糖体分离。eEF-1β催化GDP与GTP交换,利于eEF-1α循环利用。3.移位 真核生物的移位过程需要的是延长因子只有一种eEF-2。

肽链合成的延伸指第2个和以后的密码子编码的氨基酸进入核糖体,并形成肽键的过程。这个过程步骤:①进位反应,是氨基酰-tRNA的反密码子与mRNA密码在核糖体内的识别;②转肽反应,包括转位反应和肽键形成;③移位反应,是tRNA和mRNA密码在核糖体移动。这3个步骤构成一个循环,称为核糖体循环(ribosomal cycle)。

(一)原核生物蛋白质合成的延长

组装完的核糖体70S起始复合体有两个tRNA结合位点。A位点是氨酰-tRNA结合位点,P位点是肽链延伸的位点。这两个位点均位于小亚基的凹槽处,包括正在翻译的相邻密码子。

1.进位 原核生物中,fMet-tRNAfMet占据在肽酰位(P位),而A位空闲着。进位(entrance)又称注册(registration),是指一个氨基酰-tRNA按照mRNA模板的指令进入并结合到核糖体A位的过程。延长因子T(elongation factor T,EF-T)有两个亚基,分别为Tu及Ts,当EF-T与GTP结合时释出Ts,Tu与结合有氨基酰-tRNA和GTP的核糖体形成延伸四元复合物,并输送氨基酰-tRNA结合到A位与mRNA第2个密码子结合。然后GTP分解,释放出Tu-GDP及Pi。Tu-GDP在GTP供能下,由Ts催化,则又生成Tu-GTP。

2.成肽 成肽即形成肽键的反应,这个过程是在延伸因子从核糖体上解离下来的同时进行的。催化这一过程的酶称为肽酰基转移酶(transpeptidase),催化P位上甲硫氨酰-tRNA的甲硫氨酰基与A位上新进入氨基酰-tRNA的α-氨基间形成肽键。第1个肽键形成后,二肽酰-tRNA占据着核糖体A位,而卸载了氨基酸的tRNA仍在P位(图11-8)。催化的本质是使一个酯键转变成一个肽键,由新加入的氨基酰-tRNA上氨基酸的氨基对肽酰-tRNA酯键的羰基进行亲核攻击而成。

图11-8 成肽反应:P位肽酰基与A位氨基酰基之间形成肽键

3.移位 延伸反应第3个步骤称移位。原核细胞在延长因子G(elongation factor G, EF-G)的作用下,催化GTP分解供能,成肽反应后核糖体沿着mRNA的3′-端移动一个密码子的距离,空载的tRNA从E位点解离,从核糖体脱落;成肽后位于A位的带有合成中的肽链的tRNA(肽酰-tRNA)转到P位上,A位得以空出,且准确定位在mRNA的下一个密码子,以接受一个新的对应氨基酰-tRNA进位。

每一轮的核糖体循环都要连续进行进位、成肽、转位的循环过程。核糖体从5′→3′阅读mRNA中的密码子,每次循环向肽链C-端添加一个氨基酸,使肽链从N-端向C-端延长。

GTP的水解在翻译过程中有重要作用,在每掺入一个氨基酸的延伸过程中,都有2个GTP分子发生水解。在肽链延长阶段中,每生成1个肽键,都需要直接从2分子GTP(进位与转位各1分子)获得能量。加上合成氨基酰-tRNA时已消耗了2个高能磷酸键,所以在蛋白质合成过程中,每生成1个肽键平均需消耗4个高能磷酸键。GTP结合和水解与EF-Tu和EF-G作用有关。随着GTP水解成GDP,这些因子构象发生了很大变化,与核糖体分离。GTP及GDP与这些因子的结合与否成为调节它们与核糖体结合的开关。

原核生物蛋白质合成的延伸阶段见图11-9所示。

图11-9 原核生物蛋白质合成的延伸阶段——核糖体循环

①进位:当EF-T与GTP结合时释出Ts,Tu与结合有氨基酰-tRNA和GTP的核糖体形成延伸四元复合物,并输送氨基酰-tRNA结合到A位与mRNA第2个密码子结合;②成肽:P位上的甲硫氨酰-tRNA的甲硫氨酰基与A位上新进入氨基酰-tRNA的α-氨基之间形成肽键;③移位:成肽后位于A位的肽酰-tRNA转到了P位上,A位得以空出,空载的tRNA从核糖体脱落。

(二)真核生物蛋白质合成的延长

真核生物蛋白质合成的延长过程类似于原核细胞。

1.进位 真核细胞进位阶段有两个延长因子eEF-1α和eEF-1β。氨基酰-tRNA进位时需要eEF-1α与GTP、氨基酰-tRNA形成复合物,促使氨酰-tRNA进入核糖体。eEF-1β催化GDP与GTP交换,利于eEF-1α循环利用。

2.成肽 与原核生物的成肽过程类似。

3.移位 真核生物的移位过程需要的是延长因子只有一种eEF-2。相当于原核生物的EF-G,它催化GTP水解和驱动氨基酰-tRNA从A位移到P位。

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