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微卫星位点的高度多态性

时间:2022-02-09 理论教育 版权反馈
【摘要】:一般多态性基因的定义是其最频繁出现的等位基因不超过0.95,这时相应的杂合度和多态信息含量不小于0.1,这也可以作为一个基因多态性的衡量标准。杂合度也比同工酶所报道的高。与同工酶等技术相比,微卫星位点的高度多态性,以及遗传标记以孟德尔方式共显性遗传等优点,决定了SSR标记被广泛应用于生物学研究的各个领域,尤其是亲缘关系相近的或地理位置相近的群体,SSR标记也是在育种计划中运用分子标记辅助育种进行家系确定的独特工具。

一个分子遗传标记多态性程度的大小与其在群体中能够检测出来的类型多少直接有关,类似于群体遗传多态性。衡量的标准有两个:一是杂合度,它实际上是在群体随机交配的情况下,一个个体的两个等位基因处于杂合状态的概率;另一个常用的指标是多态信息含量(PIC),它是在给定一个后代基因型时,能够判断一个亲本将其某一个等位基因传递给后代的概率。一般多态性基因的定义是其最频繁出现的等位基因不超过0.95,这时相应的杂合度和多态信息含量不小于0.1,这也可以作为一个基因多态性的衡量标准。8个微卫星位点多态信息含量值从0.6.2 8.0.905 1,这充分说明本实验所用分离群体群内遗传变异大,信息含量高,符合标记-QTL连锁分析的基本设计要求,也符合对虾养殖的实际状况。

在本实验中,每个位点的等位基因数从6到16不等,与同工酶(李健等,2003;王伟继等,2001)检测到的等位基因数(1-5)相比是比较多的。杂合度(5个群体的平均杂合度分别为0.7.8 8.0.568 7.0.618 8.0.643 8.0.693 7)也比同工酶所报道的高。与同工酶等技术相比,微卫星位点的高度多态性,以及遗传标记以孟德尔方式共显性遗传等优点,决定了SSR标记被广泛应用于生物学研究的各个领域,尤其是亲缘关系相近的或地理位置相近的群体,SSR标记也是在育种计划中运用分子标记辅助育种进行家系确定的独特工具(Moore et al,1999;Wolfus et al,1997;Wright et al,1994)。

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