根据国务院总体方案，福建自贸试验区的战略定位和发展目标为：建设成为深化两岸经济合作的示范区，充分发挥对外开放前沿优势，建设21世纪海上丝绸之路核心区，打造面向21世纪海上丝绸之路沿线国家和地区开放合作新高地。
福建自贸试验区的实施范围118.04平方公里，涵盖三个片区：平潭片区43平方公里，厦门片区43.78平方公里（含象屿保税区0.6平方公里、象屿保税物流园区0.7平方公里、厦门海沧保税港区9.51平方公里），福州片区31.26平方公里（含福州保税区0.6平方公里、福州出口加工区1.14平方公里、福州保税港区9.26平方公里），累计保锐区面积21.81平方公里，约占总面积的18.5%。
福建自贸试验区主要任务有6项：（一）切实转变政府职能；（二）推进投资管理体制改革；（三）推进贸易发展方式转变；（四）率先推进与台湾地区投资贸易自由；（五）推进金融领域开放创新；（六）培育平潭开放开发新优势，含16项具体工作。
福建自贸试验区设立了省级工作领导小组和协调办公室，并在福州片区、平潭片区、厦门片区分别设立自贸试验区管理委员会。这样的管理架构，较好适应了福建自贸试验区3个片区相距较远的特点，也有利于发挥地（市）级政府的作用。
2015年，福建举全省之力建设自贸试验区，并取得了显著成效。
1.2015年贯彻落实重点试验任务
2015年4月21日挂牌以来，186项重点试验任务已实施139项，126项创新举措渐次落地，49项全国首创，50项分批、分期推向全省。经过8个多月的实践，基本理顺福建自贸试验区机制，各项工作有序推进，正引领福建省改革全面发力。自贸试验区创新举措一旦成熟后，福建省马上进行复制推广。目前已有30项创新成果在全省推广实施。
2.管理模式不断创新
一批简政放权、提高政府服务水平和服务效率的创新举措陆续推出，政府管理模式不断创新。2015年5月4日，全国首张“一照一码”营业执照在福建自贸试验区诞生。“一照一码”登记制度，将工商营业执照、组织机构代码证、税务登记证统一为一本证，号码合并为统一社会信用代码。这一创新举措推出后，企业设立时间从过去的29天缩短到最快1天。
在平潭片区，社会投资项目审批采用“一表申请、一口受理、一章审批、一次出件”，申请材料从250项减少到19项左右，项目选址到竣工验收时限从平均1年压缩到93个工作日以内。该举措被国务院自贸试验区工作部际联席会议选入最佳实践案例。
在厦门片区，覆盖国民经济和社会发展规划、土地利用总体规划和城乡总体规划，以及林业、市政、水利、海洋等专项规划审批的“多规合一”，让规划不再“打架”；项目审批“一张表”，则让建设项目申报环节由24个减少到4个。
三个片区都建立了综合服务大厅，80%以上的省级行政许可事项（共253项）下放自贸试验区实施，基本实现了项目审批不出区、企业办事不出区。
体制机制创新，为自贸试验区带来良好的营商环境，各类企业如雨后春笋般涌现。截至去年12月31日，区内共新增企业13566户，同比增长5.46倍；注册资本2807.17亿元，增长14.16倍。
3.企业通关更快捷
一批对标国际贸易通行规则的创新举措落地，企业通关更快速、更便捷、更便宜。2015年8月下旬，我省国际贸易单一窗口率先在福建自贸试验区上线试运行，推出货物进出口申报关检“三个一”（一次申报、一次查验、一次放行）系统和船舶进出境联检系统等。
据测算，企业通过省“单一窗口”平台进行进出口货物申报，申报时间从4个小时缩短至5至10分钟；船舶进境申报时间由36个小时缩短为2.5个小时，出境时间由36个小时缩短为1个小时。这一举措，同样入选了全国自贸试验区“最佳实践案例”。
一年来，驻闽各口岸部门以自贸试验区为平台，创新监管模式。2015年8月，厦门海关在全国率先启动分类监管新模式试点，辖区内保税仓储企业可同时经营保税和非保税业务，区内的仓储资源被有效盘活。
厦门片区于2015年7月在全国首创分段担保业务，保税展示交易店可根据实际销售情况按日或按笔缴付税款保证金，此举有效缓解企业一次性缴付的资金压力。年底，福州片区推出了福建自贸试验区首家区外保税商品交易中心，让市民畅享“自贸时代”的购物便利。
4.两岸要素流动更便利
一批对台交流合作的创新举措和开放措施率先实施，两岸货物、服务、资金、人员要素流动更便利。简化CEPA以及ECFA下货物进口原产地证书提交需求，仅此一项新举措，2015年就为辖区企业减免税款逾3000万元。
福建自贸试验区为创新两岸合作模式不断探路，在两岸货物贸易、人员往来、金融合作等领域持续发力，推出了一系列独有的好政策。
在平潭片区，台湾商品被允许“先验放后报关、先上架后抽检”；对台湾小家电率先单方面采信台湾检验检测机构出具的认证结果和检测结果，办理手续从90天左右缩短到1天……通关快捷让平潭对台小额贸易市场红红火火。截至目前，已入驻商户245户，其中64%来自台湾，市场总销售额突破5亿元。
两岸旅游业合作也有实质性突破，国家旅游局出台支持福建自贸试验区扩大旅行社业开放和放宽旅游从业人员限制后，我省随即明确了福建导游资格考试对台湾户籍居民开放。两岸人员往来方面，除率先实施台湾居民入境免签注和试点签发电子台胞证外，“台车入闽”也在5月实现常态化。
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