二十三、基因组学
1.什么是开放阅读框(ORF)？请写出含有一段短的开放阅读框的DNA序列。
2.什么是YAC载体的基本元件？
3.BAC是以哪种质粒为基础而构建的？哪些元件是BAC所必需的？
4.比较大基因组的克隆-克隆测序策略和鸟枪法测序策略。
5.简述在基因组中寻找STS序列的步骤。
6.什么是微卫星DNA和小卫星DNA？为什么在绘制连锁遗传图谱时微卫星DNA比小卫星DNA更适用？
7.怎样运用一套BAC克隆中的STSs来构建一个毗连群，请用不同于教材中的示意图进行说明。
8.怎样运用放射性杂交图谱对STSs进行作图。
9.表达序列标签(EST)与普通的STS有何不同？
10.从人类第22号染色体的序列可以得出哪些主要结论？
11.从人类第21号染色体的序列可以得出哪些主要结论？
12.比较“结构基因组”和“功能基因组”。
14.制备一个DNA芯片，要求其中两点中含有二核苷酸AC和AT，试说明制备步骤(可以忽略其他的点)。
15.设计一个实验：要求应用DNA微阵列或者DNA芯片来衡量在病毒感染细胞的两个阶段中病毒基因的转录情况，并说明范例结果。
16.怎样用一个SAGE实验来检测某种类型癌细胞的转录情况。请说明双标产物在此实验中的作用，并给出在此实验中所用的序列。
17.通过外显子陷阱(exontrap)能否检测到以下的DNA片段，为什么？(a)内含子(b)外显子的一部分(c)一个完整外显子，在两端有部分内含子(d)一个完整外显子，在一端有部分内含子
18.列举三种在megaYAC克隆中检测某个基因的方法。
19.(1)哪种突变引起了亨廷顿综合征？
(2)什么证据证明HD基因的突变导致亨廷顿综合征？
20.以下是通过RFLP方法对某一区域进行分析后得出的物理图谱。有数字标注的垂直线表示SmaI酶切位点，在2和3处(带圆圈)具有多态性的，1和4则不具有多态性。这段DNA经SmaI酶切后所产生的片段经电泳分离后转移到膜上，再与DNA探针(其大小及位置如图所示)进行杂交。根据下表中的信息，写出在各个单模标本所检测到的带的大小。
21.对某种遗传疾病的基因进行作图，发现该基因与RFLP中的一个名为X-21的探针连锁，用标记的X-21探针与一组人鼠杂交细胞的DNA进行杂交。下面是杂交结果，并显示了A～F组的杂交细胞含有的人染色体。请问是哪条人染色体含有该基因？
22.(1)哪种CF突变在囊肿性纤维化中最为普遍？
(2)有哪些证据证明编码CFTR的基因确实是CF？
23.什么是SNPs(单核苷酸多态性)？为什么绝大多数SNPs并不重要，只有少数有用？
24.请比较转录组学与蛋白质组学中所用技术及所含信息的异同。
参考书：
1.RobertF，Weaver.Molecular，Biology(SecondEdition)
2.GeorgeM，Malacinski，DavidFreifelder.EssentialofMolecularBiology(影印版).科学出版社
3.Lodish，Berk，Zipursky，Matsudaira，Baltimore，Darnell.MolecularcellBiology(FourthEdition)
4.郜金荣，叶林柏.分子生物学(第二版).武汉大学出版社
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