为了加强对会计信息系统审计与信息技术环境下的企业财务审计之间含义的理解，我们以注册会计师执行信息技术环境下的企业财务审计中有代表性的财务报表审计为例，与会计信息系统审计在诸多方面进行对比说明如下：
（1）审计对象。财务报表审计的对象是被审计单位的财务收支及其有关的经营管理活动；而会计信息系统审计对象则是被审计单位的会计信息系统及相关的业务处理系统。
（2）审计目标。财务报表审计的目标是对被审计单位会计报表的合法性、公允性及会计处理方法运用的一贯性发表审计意见；而会计信息系统审计目标则是对被审计单位计算机会计信息系统的安全性、可靠性、有效性和效率进行审查和评价，并发表审计意见。
（3）审计内容。财务报表审计的内容是被审计单位的财务收支及其有关的经营管理活动，以及被审计单位的各种作为提供财务收支及其有关经营管理活动信息载体的会计资料及其相关资料；而会计信息系统审计内容则是会计信息系统的开发、会计信息系统的控制、会计信息系统的功能，以及与会计信息系统有数据传递关系的相关应用系统。
（4）执行的审计准则。财务报表审计执行的是注册会计师审计准则；而会计信息系统审计执行的是信息系统审计准则。
（5）审计时间。财务报表审计是以事后审计和定期审计为主；而会计信息系统审计是事后审计、事前审计和事中审计兼而有之。
（6）审计技术。财务报表审计使用的可以是纯手工审计技术，可以是计算机辅助审计技术，也可以是二者兼而有之共同发挥作用；而会计信息系统审计使用的是手工审计技术，同时必须利用计算机辅助审计技术。
（7）审计执行者身份要求。财务报表审计对审计人员专业素质的要求侧重于会计与审计技能，并掌握一定的信息技术知识和计算机辅助审计技术，审计执行者往往是一般审计人员和注册会计师；而会计信息系统审计对审计人员素质的要求则侧重于信息技术、信息系统管理、计算机辅助审计技术，并掌握一般的审计理论与实务。审计执行者往往是信息系统审计人员和注册信息系统审计师。
从以上讨论我们看到，在信息技术环境下的财务审计，尽管在执行审计任务时审计人员会受到计算机信息系统环境的影响，但它与传统意义上的注册会计师审计无论在审计的概念、对象、目标、任务、原则等方面都基本上是一样的，只是更多地考虑在审计技术和方法上尽量使用计算机辅助审计的先进有效手段。因此，关于在信息技术环境下财务审计的有关内容，读者可参考一般的注册会计师审计学教材内容进行相关理解。而在本书中，我们将侧重于探讨关于会计信息系统审计的有关内容。
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