ExPASy（expert protein analysis system）可理解为蛋白质专家分析系统，由瑞士生物信息学研究所维护（Swiss institute of bioinformatics），提供从序列（Swiss-Prot）到结构（Swiss-Model）以及双向电泳图谱等蛋白质操作相关的全套服务。换句话说，你感兴趣的蛋白质的所有性质都可以轻松、免费、迅速、准确的从此网站上查到。ExPASy包括了许多重要的蛋白质相关数据库[如蛋白质数据库（SWISS-PROT），蛋白质家族、功能位点数据库（PROSITE），二维凝胶电泳数据库（SWISS-2D PAGE）]，蛋白质及其他生物大分子的三维图像库（SWISS-3D IMAGE），可进行蛋白质序列识别、表征，核酸→蛋白质翻译，蛋白质及核酸的同源检索，模式识别、蛋白质序列分析，蛋白质二级结构、三级结构预测，跨膜区预测，序列BLAST等。
为提高ExPASy的运行速度和满足越来越多用户的需求，ExPASy在各国建立了相应的镜像站，在中国的镜像站点是：http://cn.expasy.org/ at Peking University（图5-9）。中国用户可以通过访问此站点提高浏览速度。
图5-9 ExPASy中国镜像站点主页图
在网页中可看到，该主页面分为Databases、Tools& Software、Education & services和 Documentation 4个部分。
在Tools and Software一栏中，列举了几个常用和重要的工具，如Proteomics tools，它是一个汇总的蛋白质组学在线实用分析工具包，涉及蛋白分类、翻译、结构预测、相似检索、序列比对等。在Proteomics tools下又分成了13大类，以下是分类列表。
● [Protein identification and characterization]
● [Other proteomics tools]
● [DNA -> Protein]
● [Similarity searches]
● [Pattern and profile searches]
● [Post-translational modification prediction]
● [Topology prediction]
● [Primary structure analysis]
● [Secondary structure prediction]
● [Tertiary structure]
● [Sequence alignment]
● [Phylogenetic analysis]
● [Biological text analysis]
在每一类下面，都列举了许多相应的工具和该工具功能的简单描述，并提供该工具的链接，用户可以根据需要和喜好，选择应用不同的工具。
ExPASy是一个功能强大的数据包，囊括了蛋白质研究的各个方面，界面友好，操作简单，与其他数据库可以方便地进行链接，是蛋白质分析和研究的有力工具，有兴趣的读者可以进一步浏览和学习。
（冯春琼）
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