【摘要】：目前，新的寄生虫分类系统将人体寄生虫分类在3个真核生物界：即原生动物界、色混界和动物界。医学上一般将线形动物、扁形动物称为蠕虫；棘头动物门中的棘头虫原认为是线虫中的一类，但因其形态与线虫有明显的不同，故自成一类；将原生动物、色混界动物称为原虫；与医学有关的节肢动物称为医学昆虫或医学节肢动物。
人们对不同种类的寄生虫进行分类，目的是建立和界定寄生虫系统种群间的等级状态，追溯寄生虫演化的线索，探讨不同寄生虫种群、虫种之间的亲缘关系，了解和掌握有关寄生虫与宿主之间，特别是与人类之间的生物关系。动物生物学分类系统的阶元依次为界、门、纲、目、科、属、种，亚门、亚纲、亚科、总纲、总目和总科为中间阶元，有些种下还有亚种、变种和株。
目前，新的寄生虫分类系统将人体寄生虫分类在3个真核生物界：即原生动物界（Protozoa）、色混界（Chromista）和动物界（Animalia）。原生动物界和色混界动物为单细胞动物，而动物界动物（也称后生动物）是多细胞动物，其体内有组织器官结构。原生动物界包括阿米巴门、眼虫门、后滴门、副基体门、透色动物门、孢子虫门和纤毛虫门；色混界包括双环门；动物界包括线形动物门、扁形动物门、棘头动物门和节肢动物门。医学上一般将线形动物、扁形动物称为蠕虫；棘头动物门中的棘头虫原认为是线虫中的一类，但因其形态与线虫有明显的不同，故自成一类；将原生动物、色混界动物称为原虫；与医学有关的节肢动物称为医学昆虫或医学节肢动物。
根据国际动物命名法，寄生虫的命名采用二名制原则，以拉丁文或拉丁化的文字标明，学名是由属名和种名组成，属名在前，种名在后，如有亚种名，放在种名之后。在种名和亚种名之后是命名者的姓和命名的年份。例如，日本血吸虫的拉丁名为Schistosoma japonicum Katsurada，1904，表明该名是由Katsurada于1904年命名的。
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