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缺失亲本基因型的推断

时间:2022-02-09 理论教育 版权反馈
【摘要】:由于缺少2 #和4 #家系的父本,3 #家系的父母本,笔者根据子代中等位基因的分离对缺失亲本的基因型进行推断。对于1#家系Al个体,出现了亲本不存在的等位基因,认为此个体在这一位点发生突变或为取样错误,因此在下面的分析中排除了此个体。其中等位基因332,338来自母本,因此可以确定等位基因334来自父本,又因为子代中出现了338/338纯合基因型,所以可以推断父本 还含有等位基因338。因此,可知其亲本基因型只能为332.333.3 334/338。

由于缺少2 #和4 #家系的父本,3 #家系的父母本,笔者根据子代中等位基因的分离对缺失亲本的基因型进行推断。对于1#家系Al个体,出现了亲本不存在的等位基因,认为此个体在这一位点发生突变或为取样错误,因此在下面的分析中排除了此个体。

图28 2 #家系(上)在EN0033 位点和1#家系(下)在RS062 位点的微卫星DNA 检测

EN0033位点,有以下两种情况:① 对于2#家系,已知母本,父本缺失。母本基因型检测为 332/338,子代有4种基因型,分别为:332/334;332/338;334/338;338/338。其中等位基因332,338来自母本,因此可以确定等位基因334来自父本,又因为子代中出现了338/338纯合基因型,所以可以推断父本 还含有等位基因338。由此笔者可以得出在EN0033位点,2#家系父本的基因型为334/338。② 在3#家系中,父母本均缺失,未知其基因型。在子代中笔者观察到4种基因型:332/334;332/338;333/334;333/338,均为杂合型。因此,可知其亲本基因型只能为332.333.3 334/338。按照上述方法可以推断出RS062位点各家系缺失父母本的基因型。

表41 每个家系观察到和推断出的基因型

* *为极显著偏离Hardy-Weinberg 平衡,(P , 0.01)

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