徐光启从事了一辈子的农业科学研究，在实践中，他深刻地认识到农业的重要。觉得也应当让孙子们重视农业科学研究的重要性，了解一些农业方面的科学知识。这不仅对他们以后的生活和生存有好处，对国家也是一件好事。于是，在重新修订书稿时，就想让孙子们参与书稿的修订。
有一天，他把三个孙子——尔斗、尔默、尔路一一叫到跟前，问他们每天都读些什么书籍，做些什么样的文章。孙子们异口同声地说：“读的是《四书》《五经》，做的是‘八股文’。”
“农业书你们看不看？”徐光启又问道。
“多少也看点儿。”孙子们说。
徐光启叫三个孙子坐下，耐心地对他们说：
“我当年不在家，很少关心你们。所以，你们把读经书和作‘八股文’当作头等大事。其实，‘八股文’是天地间最没有用处的文章。做这种文章，只不过是为了应付科举考试。真正有用处的是农家之事，农书才应该是你们的必读之书。”
徐光启看着面前坐着的三个孙子，他们衣着朴素，神情也显得老实而憨厚，他点点头，表示满意，深情地对他们说道：
“你们没有染上贵族子弟那种奢华、世故的不良习气，这很好。可是，你们不肯干农活，也很少读农书，这就不太像我的孙子了。我平生不论是顺境还是逆境，也不论是教书还是做官，从来没有忘记过这个‘农’字。如今，我在家‘冠带闲住’，想编著一部《农政全书》。这可是一部包罗万象的大书啊！现在，我把你们叫来，不为别的事，就是想要你们替我做点事，要你们帮我抄书。怎么样？”
孙子们听说要他们抄爷爷写的书，非常高兴。从此，徐光启的书房就成了《农政全书》的编辑室。孙子们一边读爷爷写的《甘薯疏》《泰西水法》《北耕录》等书，一边一丝不苟地帮爷爷抄写修改好的书稿，成为爷爷的得力助手。在读书、抄书的过程中，孙子们逐渐对农业科学知识产生了兴趣。
1633年8月，七十一岁的徐光启脾脏患病，此时他正在任宰相。10月16日，徐光启病情加重，他知道自己将不久于人世。可心里还是放心不下，他拖着久病的身子，把孙子们召到身边，谆谆嘱咐他们说：
“我恐怕不能亲自把这部农书整理完了。你们一定要替爷爷把它整理完，呈送皇上……”
孙子们含着眼泪，点头答应祖父最后的嘱托。11月8日，徐光启离开了人世。儿孙们按照他生前的要求，齐心合力，把书整理好，呈送给崇祯皇帝，完成了徐光启生前未竟的事业。
经过多年艰苦的努力，徐光启编写出了农学巨著《农政全书》。该著作在徐光启逝世后六年，由文学家陈子龙等整理修改后，于1639年刊行。
《农政全书》共有六十卷，五十多万字。分农本、田制、农事（包括营治、开垦、授时、占候）、水利、农器、树艺（谷类及蔬果各论）、蚕桑、蚕桑广类（棉、麻、葛）、种植（竹木及药用植物）、牧养、制造、荒政等十二门。其中水利和荒政占篇幅较多。书中大量辑录了古代和当时的文献，也随时提出作者自己的心得与见解，是我国明末一部重要的农业科学巨著。
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