开皇二十年（600年），杨坚和独孤皇后从仁寿宫回到京城，准备彻底解决太子问题。
上朝后，杨坚开门见山地说：“我从仁寿宫回来，本来应该开开心心，不知道为什么心里觉得特别难受，你们觉得是什么原因？”
大臣们一时不敢接口，杨坚继续说：“仁寿宫距离大兴城能有多远？但我每次回来，都要重兵护卫，不像回家，倒像进了敌国！我在自己的宫殿里担惊受怕，不敢安睡，还不是因为你们这些鼠辈！”一边骂，一边命人抓了东宫的几个官员。(www.guayunfan.com)
杨素接口道：“太子当国，本应以身作则，岂料他素行不端。陛下，您还记得当年刘居士和他的那些党羽吗？他们胆大包天，竟然在北周故殿行君臣之礼。这群人都和太子关系匪浅，我请太子好好处理他们，太子竟然说与他无关，推诿责任。”
刘居士“谋反”一事，大臣们都知道详细根底，不过是一纨绔少年狂妄自大，犯了忌讳，他本人早就被处斩，这件事还被隋朝拿来当饵，设计杀掉了远在突厥的大义公主。杨素把这件事搬出来，众大臣都觉得不伦不类，根本没有人愿意附和他。
但杨坚心意已决，也不管大臣们反对的神色，继续说道：“太子根本就不配继承这个国家，皇后也早就劝我废了他！但他是我艰辛之时所生的孩子，我对他有感情，只希望他渐渐改了身上的那些毛病，才忍到今天。谁料此儿肤浅无德，看到皇后身边的侍女，都指着她们偷偷对人说：‘这些将来都是我的。’这存的是什么心？”
群臣越听越糊涂，怎么听也觉得不符合杨勇素来的行止，杨坚愈发恼怒道：“太子妃元氏刚死的时候，我怀疑是太子下毒，刚问了他几句，他就说一定要杀掉太子妃的父亲元孝矩！他和云氏在外所生的孩子，我和皇后好心要抱来教养，他竟然担心我们对孩子不利，连连派人索要！云家是什么门第，和这样的女人生了孩子，今后是要祸乱杨家的宗祠吗？我一定要废了这个逆子以安天下！”
杨坚说得起劲，却发现根本没几个人附和他，倒有元旻、元胄等人开口求情，请他慎重考虑，更有人说了太子素日的一些善政，夸奖太子为人的很多优点。杨坚整天都听皇后、杨素等人说太子的不是，今天到了朝堂，大臣们竟然众口一词地夸奖杨勇，这让杨坚大感意外。以他多年的政治经验，他也觉得有什么事情不对劲，但如今话已出口，父子间隙已成，哪里还能更改？
何况，反复对比杨勇和杨广的素质，他认为杨广更有当皇帝的素质，像杨勇这种喜欢享受又不知节制的人，今后一定是个败家子。而且杨勇资质平平，哪里挑得起国计民生的担子？反倒是杨广，既有治国的头脑，又有对外的武略，更有帝王应有的控制力，只有把江山交到这样的儿子手里，他才能放心。
杨素也不会给杨坚反悔的机会，他四处搜罗太子的“罪证”，并在太子宫殿里找出了一些点火用的枯木，说这些东西是造反用的。没几天，又有人上书状告太子竟然养了上千匹马，这么多的马匹一定是为了造反准备的。———东宫能有多大，哪里养得了上千匹马，点火用的枯木又是宫中必备之物，这些“罪证”纯属捕风捉影，但杨坚竟然深表赞同，还检讨自己太过宠溺儿子，导致儿子不成器。一番“彻查”后，太子杨勇和他的儿子都被囚禁，东宫的官员们也大多被投入监狱。元旻和元胄也没能幸免，杨坚拿王世积造反一事斥责他们，说他们收了王世积的贿赂，两位大臣被免官。
开皇二十年（600年）十月九日，大臣们在大殿之上看到了这样一幕：
大殿上早就摆放了众多精美的器物，杨坚面色阴沉地坐在大殿正中，由身披铠甲的士兵护卫，并命百官仔细看殿上陈列的物品。这时，一脸惊慌的太子杨勇被士兵押了进来，跪在地上不敢作声。杨坚命内史宣布杨勇所犯的“大罪”，并公布处罚决定：废杨勇太子之位，降为庶人，杨勇的儿女也一律降为庶人。
看到陪伴自己二十年的太子被废，杨坚也有一丝伤感，却还对杨勇说：“你罪大恶极，不要怪我无情！”
杨勇含着眼泪磕头谢恩，颤声说：“我罪该万死，陛下可怜我，饶我一命，我不敢怨恨。”磕头完毕，跌跌撞撞地由侍卫们拖了下去。众大臣看到前太子颤巍巍的背影，想起他素日的行事为人，都知道他是被冤枉的，但高颎等人都因此事被罢官，谁还敢为杨勇申辩。
杨勇被废后不出一个月，晋王杨广被册封为太子，在群臣的恭贺中，杨广终于露出满意的笑容。此时大兴城风雪交加，杨勇被囚禁在宫殿中，听着外面的欢呼声，想到自己二十年的努力，换来的只是这样的结局，泪水潸潸而下。
杨勇待人忠厚，身边也不乏忠心之人，太子洗马李纲就跑到杨坚面前为杨勇抱不平。李纲曾是北周齐王宇文宪的手下，为人正直，杨坚一直对他很信赖，并派他做杨勇的东宫僚属。杨勇喜欢玩乐，李纲曾数次规劝，所以杨坚对他印象更好。此时见他来为太子说话，杨坚不由奇怪地问：“太子被废是咎由自取，爱卿何必忧心？”
李纲说：“太子是性情中人，可以为善也可以为恶，假使陛下当初选择辅佐太子的人都是正人君子，而不是一些劝太子声色犬马的谄媚小人，太子又怎么会落到今天这个下场！这不是太子的失误，是陛下您的过错！”
李纲知道这样一番言论肯定会得罪皇帝，说不定会招来杀身之祸，但他一腔义愤不吐不快，也顾不得自身安危。他见杨坚面色阴晴不定，也并不畏惧。令他没想到的是，杨坚没有责备他，也没有与他争辩，只是有些悲伤地点了点头，命他退下。
李纲替杨勇说话没有获罪，却招来了杨素的记恨。后来杨素屡次三番地陷害李纲，李纲无奈只好选择隐居。再后来，李渊建立唐朝，推重他的为人，又请他出山做太子李建成的东宫官员，没想到李建成在玄武门之变中被弟弟李世民杀害。李世民当权后，依然看重李纲的正直，命他辅佐太子李成乾，没想到，李成乾又因谋反被废。李纲辛辛苦苦辅佐隋唐两朝三位太子，三位太子却都死于非命，也真是一个不幸之人。
年老的杨坚待下苛刻，最厌恶别人指责他的过失，却放了李纲一马，可见在他内心深处，也知道对太子的处置有不妥之处。但事已至此，没有回头路可走。想到当年处理国家大事，总有一群贤臣为自己出谋划策，而今却只有一个李纲敢于直谏，杨坚这才突然发现，在不知不觉间，那些陪自己取天下、治天下的大臣几乎全都不在身边，朝堂之上，也看不到昔日那些熟悉的面孔。
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